Repercussões da emergência do vírus Zika na saúde da população do estado do Tocantins, 2015 e 2016: estudo descritivo / Repercusiones de la aparición del virus Zika en la salud de la población de Tocantins, Brasil, 2015 e 2016: estudio descriptivo / Repercussions of Zika virus emergency on the health of the population of Tocantins state, Brazil, 2015 and 2016: a descriptive study

Objetivo: Descrever a ocorrência da febre pelo vírus Zika (ZIKV) e suas complicações no estado do Tocantins e em sua capital, Palmas. Métodos: Estudo descritivo, utilizando dados dos sistemas de informações em saúde. Resultados: A incidência de casos notificados de febre pelo ZIKV, em 2015 e 2016, foi de 295,2/100 mil e 411,1/100 mil habitantes na população geral, e de 5,9/mil e 27,8/mil nascidos vivos em gestantes, respectivamente. Maiores riscos ocorreram em mulheres, nas idades de 20-39 anos, nos municípios das regiões central e noroeste do estado, durante os meses mais quentes (fevereiro e março). A incidência de microcefalia relacionada à infecção pelo ZIKV na gestação foi de 0,06/mil nascidos vivos. Foi confirmado um caso de síndrome de Guillain-Barré decorrente da infecção pelo ZIKV. Conclusão: A febre pelo ZIKV atingiu o Tocantins intensamente, embora seus desfechos adversos tenham sido menos frequentes que em outros estados.

Objetivo: Describir la aparición de la fiebre del virus del Zika y sus complicaciones, en el estado de Tocantins y en la ciudad de Palmas, su capital. Métodos: Estudio descriptivo utilizando datos de los Sistemas Oficiales de Información. Resultados: La incidencia de casos informados de fiebre por ZIKV en 2015 y 2016 fue 295,2/100.000 y 411,1/100.000 habitantes, respectivamente y 5,9/1000 y 27,8/1000 de nacidos vivos en gestantes, respectivamente. Los riesgos mayores estuvieron en mujeres, entre los 20-39 años de edad, en los municipios de las regiones central y noroeste y en los meses más calurosos (febrero y marzo). La incidencia de microcefalia relacionada con el ZIKV en la gestación fue 0,06/1000 nacidos vivos. Se confirmó un caso de Síndrome de Guillain- Barré debido al ZIKV. Conclusión: La fiebre por el ZIKV afectó intensamente a Tocantins. Pero, sus desenlaces adversos han sido menos frecuentes que en otros estados.

Objective: To describe the occurrence of Zika virus disease and its complications in the state of Tocantins and in its capital, the city of Palmas. Methods: This was a descriptive study using data from health information systems. Results: Incidence of reported Zika virus disease cases in 2015 and 2016 was 295.2/100,000 inhabitants and 411.1/100,000 inhab. in the general population, and 5.9/1,000 and 27.8/1,000 live births, respectively. Higher risks occurred in women, the 20-39 year age group, municipalities in the central and northwestern regions of the state and in hotter months (February and March). Incidence of Zika-related microcephaly during pregnancy was 0.06/1,000 live births. One case of Guillain-Barré Syndrome resulting from Zika virus infection was confirmed. Conclusion: Zika virus disease hit Tocantins intensely, although its adverse outcomes were less frequent than in other states.

The rare enterovirus c99 and echovirus 29 strains in Brazil: potential risks associated to silent circulation

Human enteroviruses (EVs) are associated with a wide spectrum of human diseases. Here we report the complete genome sequences of one EV-C99 strain and one E29 strain obtained from children suffering from acute gastroenteritis, without symptoms of enteroviral syndromes. This is the first report of EV-C99 in South America, and the second E29 genome described worldwide. Continuous surveillance on EVs is vital to provide further understanding of the circulation of new or rare EV serotypes in the country. The present study also highlights the capacity of EVs to remain in silent circulation in populations.

Human sapovirus GI. 2 and GI. 3 from children with acute gastroenteritis in northern Brazil

Human sapoviruses (HSaV) are considered important causative agents of acute gastroenteritis in humans worldwide. However, knowledge of the genetic characteristics of the whole genome of HSaV in Brazil is limited. Here we report the complete genome sequences of six HSaVs GI.2 and two GI.3 strains obtained from children with acute gastroenteritis in the Northern region of Brazil. Next generation sequencing was used to obtain the full genome and molecular characterization of the genome was performed. Phylogenetic analysis of the genome was also performed. Only one complete HSaV GI.2 genome characterization in the country precedes that of the present study. This is the first complete genome sequence of genotype GI.3 in Brazil. The data obtained in this investigation can contribute to the augmentation of the database on the molecular diversity of HSaVs strains circulating in Brazil, and to the improvement of current typing protocols.

Inclusão de etapa de pós-processamento determinístico para o aumento de performance do relacionamento (linkage) probabilístico / Inclusion of a deterministic post-processing stage to increase the performance of probabilistic record linkage / Inclusión de la etapa de postprocesamiento determinístico para el aumento del rendimiento del enlace (linkage) probabilístico

O objetivo do presente estudo foi demonstrar a aplicação de uma etapa de pós-processamento determinístico, baseada em medidas de similaridade, para aumentar a performance do relacionamento probabilístico com e sem a etapa de revisão manual. As bases de dados utilizadas no estudo foram o Sistema de Informação de Agravos de Notificação e o Sistema de Informações sobre Mortalidade, no período de 2007 a 2015, do Município de Palmas, Tocantins, Brasil. O software probabilístico utilizado foi o OpenRecLink; foi desenvolvida e aplicada uma etapa de pós-processamento determinístico aos dados obtidos por três diferentes estratégias de pareamento probabilístico. As três estratégias foram comparadas entre si e acrescidas da etapa de pós-processamento determinístico. A sensibilidade das estratégias probabilísticas sem revisão manual variou entre 69,1% e 77,8%, já as mesmas estratégias, acrescidas da etapa de pós-processamento determinístico, apresentaram uma variação entre 92,9% e 96,3%. A sensibilidade de duas estratégias probabilísticas com revisão manual foi semelhante à obtida pela etapa de pós-processamento determinístico, no entanto, o número de pares destinados à revisão manual pelas duas estratégias probabilísticas variou entre 1.177 e 1.132 registros, contra 149 e 145 após a etapa de pós-processamento determinístico. Nossos resultados sugerem que a etapa de pós-processamento determinístico é uma opção promissora, tanto para aumentar a sensibilidade quanto para reduzir o número de pares que precisam ser revisados manualmente, ou mesmo para eliminar sua necessidade.

The aim of this study was to demonstrate the application of a deterministic post-processing stage, based on measures of similarity, to increase the performance of probabilistic record linkage with and without manual revision. The databases used in the study were the Brazilian Information System for Notificable Diseases and the Brazilian Mortality Information System, from 2007 to 2015, in Palmas, Tocantins State, Brazil. The probabilistic software was OpenRecLink, and a deterministic post-processing stage was applied to the data obtained from three different probabilistic linkage strategies. The three strategies were compared to each other, and the deterministic post-processing stage was added. The sensibility of the probabilistic strategies without manual revision varied from 69.1% and 77.8%, while the same strategies plus the deterministic post-processing stage varied from 92.9% to 96.3%. Sensitivity of the two probabilistic strategies with manual revision was similar to that obtained by the deterministic post-processing stage, but the number of matches that were referred to manual revision by the two probabilistic strategies varied between 1,177 and 1,132 records, compared to 149 and 145 after the deterministic post-processing stage. Our findings suggest that the deterministic post-processing stage is a promising option, both to increase the sensitivity and to reduce the number of matches that need to be reviewed manually, or even to eliminate the need for manual revision altogether.

El objetivo del presente estudio fue mostrar la aplicación de una etapa de postprocesamiento determinístico, basada en medidas de similitud, con el objeto de aumentar el rendimiento del enlace probabilístico con y sin etapa de revisión manual. Las bases de datos utilizadas en el estudio fueron el Sistema de Información sobre Enfermedades de Notificación Obligatoria y el Sistema de Informaciones sobre Mortalidad, durante el período de 2007 a 2015, en el municipio de Palmas, Tocantins, Brasil. El software probabilístico utilizado fue el OpenRecLink; se desarrolló y aplicó una etapa de postprocesamiento determinístico con los datos obtenidos mediante tres estrategias diferentes de emparejamiento probabilístico. Las tres estrategias se compararon entre sí y se añadieron a la etapa de postprocesamiento determinístico. La sensibilidad de las estrategias probabilísticas sin revisión manual varió entre el 69,1% y el 77,8%, incluso las mismas estrategias, añadidas de la etapa de postprocesamiento determinístico, presentaron una variación entre 92,9% y 96,3%. La sensibilidad de las dos estrategias probabilísticas con revisión manual fue semejante a la obtenida por la etapa de postprocesamiento determinístico, sin embargo, el número de pares destinados a la revisión manual por las dos estrategias probabilísticas varió entre 1.177 y 1.132 registros, frente 149 y 145 tras la etapa de postprocesamiento determinístico. Nuestros resultados sugieren que la etapa de postprocesamiento determinístico es una opción prometedora, tanto para aumentar la sensibilidad, como para reducir el número de pares que necesitan ser revisados manualmente, o incluso para eliminar su necesidad.